科技服务

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

基因组denovo测序

产品简介

近三余载,mtk骁龙量测序新水平的非常迅猛不断快速发展,所以地深入学习推进了全dna遗传组测序操作的进行,环球不存在几千百种的花草和爬行动物顺利完成了全dna遗传组测序操作。经由全dna遗传组测序,消费者行得到动物群的全dna遗传组字段图谱,所以为该动物群后期的的研发探讨和企业化应该用逐步形成根基。由于mtk骁龙量测序新水平的不断快速发展,资金的减少,动花草dna遗传组主装就不再 是涿州购房顾问的实用新型,假定您秉承于该动物群的深入学习研发探讨,denovo测序主装它的dna遗传组势必会深入学习推进您的研发探讨多线程。 DNA组重新测序(De novo sequencing)是再不依懒参考资料DNA组的情況下对某植物鱼类来进行DNA组测序及拼结装配,然而画出该植物鱼类的全DNA组字段图谱。DNA组测序仅仅可以提升该植物鱼类的全DNA组字段图谱,同時也为事件调查植物鱼类起源于进一步及目标条件满足性的设计奠定基础性了基础性。

研究内容

基因组Survey:
1) K-mer分析以及基因组大小估算;2) 杂合率估算;3) 初步组装;4) GC含量评估。
基因组组装:
1) 组装结果评估;2) GC-Depth分布分析;3) GC含量分布分析;4) 测序深度分析;5) 常染色体区域覆盖度评估(需要客户提供BAC或者Fosmid序列);6) 基因区覆盖度评估(需要客户提供EST或者转录组序列)。
基因组注释:
1) repeat注释;2) 基因预测;3) 基因功能注释;4) ncRNA注释。
比较基因AG8九游会体育集团分析:
1) 基因聚类分析(也叫基因家族鉴定,动物TreeFam;植物OrthoMCL);2) 物种系统进化分析;3) 物种分歧时间估算(需要标定时间信息);4) 基因组共线性分析;5) 全基因组复制分析(动物WGAC;植物WGD)。
定制化个性化分析:
结合客户需求,协商确定个性化分析内容。

结果展示

送样建议

1)  样品类型:DNA;
2)  样品浓度:≥50 ng/ul(Qubit定量);
3)  样品总量:>60ug(Qubit定量);
4)  样品纯度:OD260/280:1.7 ~ 2.2;OD260/230≥0.5;260吸收峰正常不偏移;无蛋白质、RNA或肉眼可见杂质污染;
5)  若提供组织样品,则植物样本需为无菌黄化苗、组培样品或嫩叶;

6)若需要做Hi-C测序,则需要提供新鲜的活体。
注:需从同一个体取样,预防由于个体差异对后续拼接造成的影响,调研图和精细图也需要从同一个体取样;如无选取同一个体的条件,须再沟通决定取样方式。

010-80543251

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